Amnistía Internacional lleva mas de 50 años documentando el uso de la tortura y otros malos tratos en México, en las décadas de los 60's, 70's y 80's la tortura se utilizó de manera generalizada y sistemática en la "guerra sucia" contra los presuntos grupos armados de oposición y contra personas a las que se le consideraba opositores políticos.
Las autoridades, a menudo, han ignorado, o incluso han permitido tácitamente, el uso de la tortura u otros malos tratos, al considerarlo "necesario" para que la policía y las Fuerzas Armadas pudieran atrapar a presuntos delincuentes y tranquilizar a la opinión pública. Estacultura de la impunidad aún persiste. En los últimos años, se han formulado denuncias de tortura y otros malos tratos contra agentes de los cuerpos de policía tanto federales como estatales, contra agentes de la policía judicial y la policía municipal, y contra miembros del ejército y la marina que desempeñan funciones policiales. La tortura y los malos tratos se han utilizado para lograr diversos objetivos: para obtener confesiones o declaraciones que impliquen a otras personas, para obtener información, para obtener dinero mediante extorsión, y para inspirar temor y lograr un sometimiento.
Desde 2006, muchos miles de personas han desaparecido también en México. Aunque la mayoría desaparecieron, al parecer, a manos de bandas criminales, un gran número de desapariciones forzadas han sido obra de la policía y las fuerzas de seguridad, en ocasiones en connivencia con bandas delictivas. Las pocas víctimas de desaparición forzada cuyos restos se han hallado mostraban señales de haber sufrido tortura y otros malos tratos.